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IgA肾病的发病原因实际上还是多种多样的，首先来说它是和感染有关系的一种免疫复合物病，与感染相关的感染的包括上呼吸道感染，尤其是病毒感染，另外还有细菌、支原体等等其他方面的病原菌也是可以的，这是一个。
另外它是通过病毒或者是有一些过敏源，或者是感染源都是可以的。通过黏膜也就是说通过鼻腔、口腔、泌尿系、胃肠道等等的这些黏膜进入到体内，从黏膜激发了黏膜产生了IGA2。
IGA分两种，一种是IGA1，一个是IGA2，这两个都是一个抗体。IGA2在黏膜表面分泌之后进入血液，血液当中刺激骨髓产生的是IGA1。在血液当中大量的是IGA1是存在的，在正常情况下是由血液当中通过肾脏进行肾小球系膜区有一些吞噬细胞给它清除了，这是正常人。但是在IGA生病的孩子他们本身的IGA不能形成一个正常的抗体，它是有缺陷的，主要的缺陷是糖基化异常。在IGA形成的过程当中有一部糖基化、糖基化酶的缺陷，造成了出现分泌的IGA1不正常，是有缺陷的。这种有缺陷的IGA在血液当中是单个存在的少，聚合的多，它是更倾向于聚合。聚合型的IGA在沉寂到肾脏的时候它就容易造成一个肾脏损伤。
实际上在肾脏里边发现的IGA也还是一个IGA1存在的一个免疫复合物，它的形成主要是在血液当中聚合型的IGA有时候有缺陷的，所以它作为一个抗原，产生了自己自身的抗体，然后激活补体，再到肾脏的时候在沉积到肾小球的系膜区造成了肾小球系膜区的一个免疫复合物炎症造成的。
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